乳腺癌是一种常见的恶性肿瘤,每年有数百万的女性被诊断出患有这种疾病。如果能够在早期发现乳腺癌,就有可能通过治疗提高存活率和降低死亡率。但是,目前的乳腺癌筛查方法,如乳房X光片和活检,都有一定的局限性,比如误诊率高、侵入性强、成本高等。因此,科学家们一直在寻找一种更简单、更准确、更便捷的乳腺癌检测方法。
山东大学第二医院检验科王传新、杜鲁涛和李娟团队最近在《自然·通讯》上发表了一篇关于一种新型早期乳腺癌诊断技术的文章【1】。他们发现,外周血单个核细胞(PBMCs)中的四个DNA甲基化位点可以作为检测早期乳腺癌的生物标志物,并基于此开发了名为BC-mqmsPCR( Breast cancer multiplex quantitative methylation-specific PCR )的检测方法。
BC-mqmsPCR的原理是什么呢?简单来说,DNA分子上存在着某些碱基(C)被一个甲基(CH3)修饰的现象,这种修饰可以影响DNA上的基因是否被激活或关闭,从而调节细胞的功能和命运。在正常情况下,DNA甲基化是一种稳定的遗传信息,可以维持细胞的正常状态。但是,在某些情况下,DNA甲基化会发生异常变化,导致基因表达失调,进而引发各种疾病,包括癌症。可以通过荧光定量PCR定量检测甲基化和非甲基化的基因的含量,判断甲基化是否发成异常变化。
BC-mqmsPCR 基于甲基化特异性PCR(ms-PCR),原理见下图
模板DNA在经过亚硫酸盐处理后,发生甲基化的CpG岛内CpG位点5 一端胞嘧啶保持不变;而未发生甲基化的CpG岛内CpG位点5 一端胞嘧啶转化为尿嘧啶,即C→U。ms-PCR中设计两对引物,即一对结合处理后的甲基化DNA链(引物对M:NNNNCGNNNN),另一对结合处理后的非甲基化DNA链(引物对U:NNNNCANNNN)。检测ms-PCR扩增产物,如果用引物M能扩增出片段,则说明检测位点存在甲基化;若用引物U扩增出片段,则说明被检测的位点不存在甲基化。
王传新团队在2020年5月至2022年7月间,从中国6个省的10家医院共招募了820名受试者,其中包括未经治疗的乳腺癌患者(没有患其他癌症和炎症性疾病),其他肿瘤患者,以及没有恶性疾病且年龄和种族相匹配的健康受试者。
在经过入排标准筛选和质量控制之后,最终有781名受试者被纳入本研究。所有患者被分到三个队列:队列I(标志物发现组),包括50名乳腺癌患者和30名健康受试者,鉴定PBMCs中存在的乳腺癌特异性DNA甲基化标记;队列II(标志物确认组),包括110名乳腺癌患者和90名健康受试者,炎症并确定标志物;队列III(多中心队列),包括206名乳腺癌患者,170名健康受试者和125名其他肿瘤患者。
通过对队列I测序数据的分析比较,王传新团队初步选择了8个候选甲基化标记,包括4个高甲基化标记和4个低甲基化标记。随后,他们在队列II中检验了这8个候选甲基化标记的效果,结果显示,4个低甲基化标记不能很好地区分乳腺癌患者和健康受试者;而4个高甲基化标记复现了队列I的研究结果。于是,王传新团队就以这4个高甲基化标记为基础,开发了可在一次反应中对四种甲基化标记物进行多重定量的乳腺癌高效诊断方法——BC-mqmsPCR。基于队列III的研究数据报告了BC-mqmsPCR的性能,他们的研究结果表明,这4个DNA甲基化位点可以作为乳腺癌的高效诊断方法,其准确度(AUC)为0.940,灵敏度为93.2%,特异度为90.4%。更重要的是,BC-mqmsPCR在检测早期乳腺癌和小肿瘤(≤1.5厘米)方面,优于现有的临床诊断方法,如乳房X光片和活检。此外,BC-mqmsPCR还可以区分乳腺癌和其他类型的癌症,其准确度(AUC)为0.913。
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参考文献:
【1】 A multiplex blood-based assay targeting DNA methylation in PBMCs enables early detection of breast cancer
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