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Omicron冲击波席卷全球,传染性比Delta高5倍?

人阅读 发布时间:2021-12-06 13:42

奥密克戎

南非报告新冠变异毒株。据WHO声明,南非于11月24日首次向该机构报告Omicron(B.1.1.529)新冠病毒变异株,但首例已知的变异株感染来自11月9日在该国收集的一个标本,并在2周之内于南非各地成为主流病毒株。世界卫生组织2021年11月26日将该变异株认定为第五种“令人担忧的变异株”(Variant of Concern,VOC),并命名为奥密克戎(Omicron)变异株。
  南非突变株
(来源:世卫组织官网) 相比先前的新冠变异株,奥密克戎变异株(Omicron)出现后,各国对其重视程度明显更高一些。全球范围内,南非、以色列、博茨瓦纳、比利时、英国和中国香港均出现奥密克戎变异病毒感染者。

2020年6月宣布 “放弃疫情防控政策” 的英国,在11月26日就与包括南非在内的纳米比亚、津巴韦布、博茨瓦纳、莱索托和史瓦蒂尼六个国家断航。目前,英国、美国、澳大利亚、加拿大、日本等多个国家对南非实施航空旅行禁令,以色列和日本随后更是限制外国旅客入境。

疫情防控

B.1.1.529变种可能具有500%的强大感染力

Omicron突变株的传染速度可能远高于之前的任何突变株,著名的疾病建模科学家Weiland估计,Omicron突变株的传染性比原始毒株高500%,这是迄今为止最令人震惊的统计数字;相对比,Delta突变株的传染性可能比原始毒株高70%-200%。

突变株

(Omicron的传染性超过Delta突变株!图源:ft.com)


Omicron突变株的传染性为什么这么高?

奥密克戎(Omicron)是迄今为止变异程度最高的新冠变异株,至少存在50个变异,其中有32个发生在刺突(Spike)蛋白上。发生于刺突蛋白的变异可能会导致变异株:复制能力增强、传染性增强及免疫逃逸可能性的存在。

Omicron突变株的Spike(S蛋白)有32个突变,是目前突变株中S蛋白突变最多的;相对比的是Delta突变株在S蛋白上有9个突变。其与Delta和Alpha突变株有多处重合,因此该突变株可能有复制能力增强的特征。

原始毒株


Omicron在刺突蛋白上的突变一共有32个(图源:the-sun.com)

下面这张图非常好,标记了每种突变的意义。Jeffery Barrett博士列出了这些突变,Omicron突变株综合了几个VOC最关键的突变:Alpha,Beta,Gamma的N501Y;Alpha的P681H及Delta的T478K>>新冠相关突变株信息点击查看
 

(Omicron的突变位点。图源:推特@jcbarret)


红色意味着尤其令人担忧,Omicron有9个。
紫色意味着新的突变,且实验室数据显示有威胁。
意味着这些突变位置很重的,但科学家还不知道其生物学特征。
蓝色表示需要更多证据来验证。
绿色表示这些突变已被验证过,不需要担心。


Omicron突变特征可能的影响

刺突蛋白(S蛋白)是新冠病毒的关键部分,新冠病毒通过它识别人体ACE2蛋白,进入人体细胞。这个蛋白也是我们免疫系统识别新冠病毒的关键位点,是新冠疫苗和中和抗体疗法设计研发的主要靶标。

就好比是射箭一样,靶子变得奇形怪状了,就很难射中了。

针对奥密克戎毒株的“极其大量”的突变,许多研究人员认为,这些突变很可能会改变新冠病毒入侵细胞的特征,并且可能造成免疫逃逸。

换句话说,存在这样一种可能性:新冠Omicron毒株传染性、致病性和免疫逃逸能力全部加强,从而出现更多的突破性感染病例,并使得新冠疫苗的保护效力、中和抗体疗法的疗效大幅下降。

 


引用专家从突变位点上的理论推测:

①Omicron突变株的RBD区具有15个突变,是RBD突变最多的突变株,可能会影响疫苗和中和抗体效果

②Omicron具有nsp6-del105-107,可能会影响固有免疫及T细胞免疫。

③Omicron的Furin切割位点附近有H655Y+P681H+N679K突变,可能会增强病毒复制能力和感染力。(在furin切割位点附近出现的突变可能让S蛋白更容易被切割,帮助病毒进入呼吸道的上皮细胞,从而增强病毒的感染能力。Delta变种在furin切割位点附近携带着P681R突变,这一突变被认为是导致Delta变种传播力增强的重要原因之一。)

④Omicron的N蛋白具有R203K/G204R,可能会增加病毒传播力和毒性。

因此从目前的突变位点上推测,奥密克戎变异株的传染性要远强于德尔塔变异株。

*以上均为理论推测,Omicron突变株是否有潜力成为下一代新冠主要流行毒株,仍然需要未来一段时间的流行病学数据进一步验证。


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  • SARS-CoV-2 Nucleocapsid protein, His tag (P13L, Δ31-33, R203K, G204R)

  • SARS-CoV-2 Spike RBD, His Tag (G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H)

  • Biotinylated SARS-CoV-2 Spike RBD, His, Avitag (G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H)

  • SARS-CoV-2 Spike NTD, His Tag (A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, ΔN211, L212I, ins214EPE)

备注:Δ69-70表示69-70位的氨基酸缺失;ins214EPE表示214位插入EPE氨基


★联系方式:华美生物官网:www.cusabio.cn微信公众号:关注本公众号,聊天界面即可服务QQ在线客服:1031906505微信在线客服:Cusabio01针对全球SARS-CoV-2的主要变种,武汉华美CUSABIO可提供多种标签的优质突变抗原。绝大多数突变抗原已验证生物活性。

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新冠突变体相关蛋白(活性验证)

Recombinant Human Novel Coronavirus Nucleoprotein(N)(R203K,G204R) (Active)(CSB-EP3325GMY(M12))

来源:E.coli

标签:N-terminal 6xHis-tagged

纯度:Greater than 96% as determined by SDS-PAGE.

新冠突变体相关蛋白(活性验证)

Recombinant Human Novel Coronavirus Nucleoprotein(N)(D63G,R203M,D377Y) (Active)(CSB-EP3325GMY(M14))

来源:E.coli

标签:N-terminal 6xHis-tagged

纯度:Greater than 85.7% as determined by SDS-PAGE.

新冠突变体相关蛋白(活性验证)

Recombinant Human Novel Coronavirus Spike glycoprotein(S) (E484K),partial (Active)(CSB-MP3324GMY1(M8)h8)

来源:Mammalian cell

标签:C-terminal mFC-tagged

纯度:Greater than 90% as determined by SDS-PAGE.

 

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