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来势汹汹|流行SARS-CoV-2变异株产品大集合

人阅读 发布时间:2021-08-27 10:06

2019年底爆发的COVID19疫情仍在全球肆虐。SARS-CoV-2,作为这种流行病的起因,突变速度令人瞠目结舌。SARS-CoV-2仅用了一年多的时间,从 Alpha 发展到 Lambda,让WHO用了将近 1/2 的希腊字母来为其变异株命名。2020年12月末,在英国发现SARS-CoV-2变异株Alpha,至此,英国疫情失控。紧接着,在南非发现了变异株Beta,在印度发现了变异株Delta,在秘鲁发现了变异株Lambda。

(来源:世卫组织官网)

依旧触目惊心!在全球范围内,截至 2021 年 8 月 25 日 CEST 下午 4:38,已向世卫组织报告了 213,050,725 例 COVID-19 确诊病例,包括 4,448,352 例死亡。

新冠突变株简介

世界卫生组织从2020年1月起一直在监测和评估全球新冠病毒的变异,建立了区分新出现的SARS-CoV-2变体的分类系统:Variants of Concern (VOCs)和Variants of interest(VOIs)。

如Alpha (B.1.1.7)、Beta (B.1.351)、Gamma (P.1)和Delta (B.1.617.2),均与传播性和毒力增强有关,被列为"令人担忧的变异株"(Variants of Concern,VOCs) “

如Eta(B.1.525)、Iota (B.1.526)、Kappa(B.1.617.1)和Lambda (C.37)等被列为"值得关注的变异株"(variant of interest, VOIs)

(来源:世卫组织官网)

需要注意的是,VOC、VOI列表并非一成不变,当一个突变株对疫情的影响越来越大就有可能被 “升级”。反之,有的突变株也会因其威胁降低而被 “降级”。

●SARS-CoV-2 Alpha | B.1.1.7 (英国突变株)

Alpha(B.1.1.7)突变株于2020年12月底, 英国向世卫组织报告了一种被命名为 VUI 202012/01(亦称为B.1.1.7毒株) 的新冠病毒变体。

Alpha株的 S蛋白突变: HV69-70del, Y144del, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H; N蛋白突变:D3L, R203K, G204R, S235F。

●SARS-CoV-2 Beta | B.1.351 (南非突变株)

Beta(B.1.351)突变株, 南非于2020年12月检测到一种新冠病毒变体,出现了 N501Y 突变,南非将其命名为 501Y.V2变体 ,该变体正在南非三个省中迅速传播。

Beta株的S蛋白突变:L18F、D80A、D215G、R246I、K417N、E484K、N501Y、D614G、A701V,其中3个突变 (K417N、E484K、N501Y) 位于RBD区域,提高了与ACE2受体的结合亲和力。N蛋白突变:T205I。

●SARS-CoV-2 Gamma | P.1 (巴西突变株)

Gamma(P.1)突变株于2020年11月在巴西被确认,爆发了该国第二波疫情,还同时曝出康复者二次感染的问题。

Gamma株的S蛋白突变:L18F、T20N、P26S、D138Y、R190S、H655Y、T1027IV1176、K417T、E484K和N501Y,有3个突变(L18F、K417T、E484K)位于RBD区域;N蛋白突变:P80R。

●SARS-CoV-2 Delta | B.1.617.2 (印度突变株)

Delta(B.1.617.2)突变株,最早发现于2020年9月印度报告的新冠肺炎病例中,世卫组织于2021年5月10日将delta变异株纳入全球需关切的新冠病毒变异株。

Delta株的S蛋白突变:T19R, G142D, EF156-157del, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N;N蛋白突变:D63G, R203M, D377Y。

●SARS-CoV-2 Kappa | B.1.617.1 (印度突变株)

Kappa(B.1.617.1)突变株与Delta来自同一个株系,在印度的疫情中也扮演了重要角色。在3月底时,Kappa曾经占了印度新冠基因组测序结果的一半。截至7月1日,Kappa在全球50个国家有记录。

Kappa株的S蛋白突变: (T95I)、G142D、E154K、L452R、E484Q、D614G、P681R和Q1071H ;N蛋白突变:R203M, D377Y。

●SARS-CoV-2 Lambda | C.37 (南美突变株)

Lambda(C.37)突变株在6月14日才WHO被归入VOI。这一突变株最早于2020年12月发现,发现地是南美的秘鲁。与很多VOC与VOI一样,Lambda出现后迅速在发现地 “占山为王”,在2021年4月时秘鲁当地的新增病例中,Lambda占比已经超过了80%。

Lambda株的S蛋白突变:G75V、T76I、del247/253、L452Q、F490S、D614G和T859N。N蛋白突变:P13L, R203K, G204R, G214C。

△Lambda突变株的突变位点

(来源:SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits higher infectivity and immune resistance[J]. bioRxiv, 2021.)

针对全球SARS-CoV-2的主要变种,武汉华美CUSABIO可提供多种标签的优质突变抗原。绝大多数突变抗原已验证生物活性。

华美生物已经建立新冠病毒突变株抗原库,助力新型冠状病毒研究,高质量SARS-CoV-2相关科研产品持续更新中,包括新冠病毒相关ELISA试剂盒、S蛋白/抗体、N蛋白/抗体、RBD纳米抗体、Spike RBD抗体对、突变体蛋白、新冠非结构蛋白、新冠病毒-宿主互作蛋白等相关产品!

部分产品验证数据

新冠突变体相关蛋白(活性验证)

Recombinant Human Novel Coronavirus Nucleoprotein(N)(R203K,G204R) (Active)(CSB-EP3325GMY(M12))

来源:E.coli

标签:N-terminal 6xHis-tagged

纯度:Greater than 96% as determined by SDS-PAGE.

新冠突变体相关蛋白(活性验证)

Recombinant Human Novel Coronavirus Nucleoprotein(N)(D63G,R203M,D377Y) (Active)(CSB-EP3325GMY(M14))

来源:E.coli

标签:N-terminal 6xHis-tagged

纯度:Greater than 85.7% as determined by SDS-PAGE.

新冠突变体相关蛋白(活性验证)

Recombinant Human Novel Coronavirus Spike glycoprotein(S) (E484K),partial (Active)(CSB-MP3324GMY1(M8)h8)

来源:Mammalian cell

标签:C-terminal mFC-tagged

纯度:Greater than 90% as determined by SDS-PAGE.

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